Python [Python] Logistic regressionの結果をForest plotで図示する
statsmodelsでLogistic regressionやLog binomial regressionした結果を解釈するときに，数字やカテゴリーが多くなりすぎると解釈がとても大変になる．そこで，meta-analysisなどで頻繁に...
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Python Docker [Python] Dockerでpygraphvizをインストールする
この記事では，PythonにpygraphvizをDocker, docker-compose.ymlを用いてインストールする方法を紹介する．また，Dockerのイメージにはjupyter notebookのofficial image(d...
Python [Python] statsmodelsでnegative binomial regressionを用いるときの落とし穴
statsmodelsでNegative Binomial Regressionをかけようと思ったら，想像以上の落とし穴があったのでここに記録を示す．Negative binomial RegressionはPoisson Regressi...
Python [Python] 一般化線形混合モデル(glmm)をGPBoostで実装する
Pythonはよく，Rで当たり前のように出来ることが実装されていないと言われる(実際そう感じる)．その状況を徐々に改善していこうとPythonista達が新しいパッケージを作成していってくれている．今回は，Rで出来るけどPythonでなかな...
Git/Github SphinxとGitHub Pagesで公開したページをGoogleの検索で表示させる
SphinxでGitHub Pagesに公開する方法論はWebに多く有るが，GitHub Pagesで公開した後に検索でヒットさせる方法を書いてあるページは少なかったので，ここで紹介．Google Search Console, Googl...
Python [Python] statsmodelsのLogistic RegressionでOdds Ratioを求める
この記事では，Pythonのパッケージの一つであるStatsmodelsを用いたLogistic RegressionでOdds Ratioを計算する方法を紹介する．また，Logistic regressionを行うまでのクリーニング方法に...
Python [Python] Pandasのメソッドチェーンを活かしたデータクリーニング
この記事では，調査によって得られる質問表からのデータのクリーニングをPandasのメソッドチェーン(method chaining, 以下chaining)を用いるとコードの可読性が飛躍的に向上するお話と，クリーニングの際の現在の僕のベスト...
Docker PyPI，SphinxでのOSS公開をDockerで完結させるためのベストプラクティス
PyPIにライブラリを公開する説明記事は数多くあるが，意外とDockerでそのuploadをどうやって完結させるか書いてある記事は少ない． なので，この記事では，PyPIへのライブラリの登録 -> Sphinxでドキュメントの登録までの流れ...
Python [Python] 中級者以上のデータサイエンティストにお勧めの本，4冊+α
この記事では中級者以上のPythonプログラマーにお勧めの，"pythonのcode writing"に関する本を紹介する．特に，僕自身がデータサイエンスをやっているので，データ解析に関わるPythonの便利な記法などがまとめられた本を紹介...
Python [PyPI] pipで依存パッケージをインストールさせる，OSS開発者向け
PyPIにOpen Source Software (OSS)を上げたが，pipで依存パッケージ(dependencies)をインストールしてくれず，嵌ったのでその一つの解決方法．まず検索して出てくる方法としては，setup.py の se...